بررسی تنوع ژنتیکی ارقام گلابی با استفاده از نشانگر مولکولی ریزماهواره (SSR)

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران

2 دانشیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

3 استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران

4 دانشیار، بخش باغبانی، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر کرج، کرج، ایران

چکیده

به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی و گروه‌بندی ارقام مطالعه‌‌شده‌ی گلابی براساس 12 جفت آغازگر و تعیین فاصله ژنتیکی بین آن‌ها، 20 رقم از دو گونه که از منشاء گونه‌های شرقی و غربی در موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر کرج بودند، با نشانگر مولکولی (SSR) مورد ارزیابی قرار گرفت. نشانگرهای مورد استفاده، درمجموع 273 باند با اندازه 100 تا 150 جفت باز و به‌طور متوسط هر ترکیب آغازگری 46/6 باند چندشکل تولید کرد. میانگین 33/90 درصد برای چندشکلی، 654/0 محتوای اطلاعات چندشکل (PIC)، 962/0 شاخص اطلاعاتی شانون و شاخص نشانگری 69/2 نشان‌دهنده وجود تنوع ژنتیکی زیاد ارقام و گونه‌های موردبررسی بود. تجزیه خوشه­ای صفات مولکولی بر اساس ضریب تشابه دایس، ارقام را به چهار گروه تقسیم کرد. تغییرات ضریب تشابه دایس بین 58/0 تا 95/0 نشان‌دهنده وجود تنوع ژنتیکی بالا در بین ارقام موردبررسی بود. تجزیه مؤلفههای اصلی نشان داد که سه مؤلفه اول در مجموع 50/54 درصد از کل تنوع ژنتیکی را توجیه نمودند. بر اساس نتایج تحقیق حاضر چهار آغازگر BGT23b،NH030a ، NB103a و NH036b می‌توانند به‌عنوان ترکیبات آغازگری مفید و مطلوب برای تفکیک ارقام معرفی شوند، به‌طوری‌که می‌توان نتیجه گرفت که این گروه آغازگرها در غربال جمعیت ارقام گلابی قابل استفاده می‌باشند.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Investigation of Genetic Diversity of Pyrus Cultivars Using Microsatellite Molecular Marker (SSR)

نویسندگان [English]

  • Omid Asadollahi 1
  • Abdollah Ehtesham Nia 2
  • Seyed Hesamodin Hejazi 3
  • Hamid Abdollahi 4
1 MSc Graudate, Department, of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran
3 Assistant Professor, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Lorestan University, Khorramabad, Iran
4 Associate Professor of Department of Horticulture, Seed and Plant Improvement institute, Karaj, Iran
چکیده [English]

In order to study the genetic diversity and grouping among 20 cultivars (from two species) of Pyrus from eastern and western species in the Research Institute of Breeding and Preparation of Seedlings and Seeds of Karaj based on 12 pairs of primers were evaluated with molecular marker (SSR). The markers used produced a total of 273 bands with a size of 100 to 150bp and, on average, each primer combination produced 6.46 polymorphic bands. The average of 90.33% for polymorphism, 0.654 polymorphic information content (PIC), 0.962 Shannon information index and 2.69 marker index indicated the existence of high genetic diversity of cultivars. Cluster analysis of molecular traits based on Dice similarity coefficient divided the cultivars into four groups. Changes in Dice similarity coefficient between 0.58 and 0.95 indicated the existence of high genetic diversity among the studied cultivars. Principal component analysis showed that the first three components together accounted for 54.50% of the total genetic diversity. Based on the results of the present study, four primers BGT23b, NH030a, NB103a and NH036b can be introduced as useful and desirable primer compounds for cultivar differentiation, so that it can be concluded that this group of primers can be used in screening the population of pear cultivars.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Primer
  • Cluster analysis
  • Polymorphism
  • Genetic distance
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)
دوره 12، شماره 2
اسفند 1400
صفحه 1-9

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار