دانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Co-silencing of Thebaine 6-O-demethylase and Codeine O-demethylase in Papaver somniferum L., Using Virus-Induced Gene Silencingخاموشی همزمان ژنهای تبائین 6- O- دمتیلاز و کدئین O- دمتیلاز در گیاه دارویی شقایق با روش القاء ویروسی110226510.22084/ab.2017.2265FAپرویننوروزی مقدمدانشجوی کارشناسی ارشد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآباداحمداسماعیلیدانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآبادفرهادنظریان فیروز آبادیاستاد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرمآبادJournal Article20140618<em>Papaver somniferum</em> remains the sole commercial source for narcotic and variety of semisynthetic drugs. Thebaine 6-O-demethylase (<em>T6ODM</em>) and codeine O-demethylase (<em>CODM</em>) genes are related the dioxygenase family that occur at the end of biosynthesis of these alkaloids in this plant. For silencing of <em>CODM</em> and <em>T6ODM</em> genes in <em>Papaver somniferum</em>, a TRV2-based construct containing a conserved sequence of <em>DIOX</em> from the coding region of <em>T6ODM </em>and <em>CODM</em> was designed for simultaneously silencing of two mentioned genes. Emerging first leaves of 2 to 3-week-old seedling were infiltrated with <em>Agrobacterium tumefaciens</em> harboring silencing construct, or the empty vector (TRV2) as a control. Analysis of gene expression at the transcript level by real-time quantitative PCR (polymerase chain reaction) technique showed 86 and 87 percent reduction in gene expression of <em>CODM</em> and <em>T6ODM</em> compared with control plants, respectively. This study demonstrated the efficiency of this method for knockdown the transcript levels of specific BIA biosynthetic genes.گیاه شقایق تنها منبع تجاری برخی آلکالوئیدهای مهم دارویی است. دو آنزیم مهم به نام تبائین 6-O-دمتیلاز (Thebaine 6-O-demethylase; <em>T6ODM</em>) و کدئین O-دمتیلاز (Codeine O-demethylase; <em>CODM</em>) در انتهای مسیر بیوشیمیایی آلکالوئیدهای بنزیل ایزوکوینولینی این گیاه وجود دارند. در این مطالعه فعالیت بیانی ژنهای دو آنزیم مذکور با روش VIGS (Virus-Induced Gene Silencing) مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور، سازهای براساس ناقل TRV2 که دارای توالی حفاظت شده ژن <em>DIOX</em> (که مشترک با بخش انتهایی ژنهای <em>T6ODM</em> و <em>CODM</em>) میباشد، طراحی شد. برگهای اولیه گیاه دو تا سه هفتهای کشت شده در گلدان با آگروباکتریوم دارای سازه خاموشی و برای گیاهان کنترل با آگروباکتریوم حاوی ناقل TRV2 خالی مایهزنی شدند. بررسی بیان ژن در سطح نسخهبرداری با فن Real Time PCR بهترتیب نشاندهنده کاهش 86 و 87 درصدی بیان ژنهای <em>CODM</em> و <em>T6ODM</em> بود. این مطالعه اثبات کرد که VIGS ابزار موثری برای کاهش سطوح نسخههای ژنهای بیوسنتزی بنزیل ایزوکوینولینهاست.https://ab.basu.ac.ir/article_2265_6c13e852a2f7f795f9b8a14f5bf248fd.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Isolation and Identification of Metribuzin Herbicide-Degrading Bacteria from Contaminated Cultivated Soils of Zanjan Provinceجداسازی و شناسایی باکتریهای تجزیهکننده علفکش متریبوزین در خاکهای آلوده تحت کشت استان زنجان1118226610.22084/ab.2017.2266FAزهرهطاهریدانشجوی کارشناسیارشد گروه زیستشناسی و علوم محیط زیست، دانشکده علوم، دانشگاه زنجان، زنجانفروزانقاسمیان رودسریاستادیار، گروه زیستشناسی و علوم محیط زیست، دانشکده علوم، دانشگاه زنجان، زنجانمعصومهافشاریدانشجوی کارشناسیارشد گروه زیستشناسی و علوم محیط زیست، دانشکده علوم، دانشگاه زنجان، زنجانJournal Article20160720The herbicide metribuzin is a triazine that remains in soil for long periods. It contaminates groundwater pollution and causes biological toxicity that causes concern worldwide. Microbial degradation plays a major role in removing triazine. This study was done to identify and isolate local bacteria for efficient degradation of metribuzin in the soils of Zanjan province. For this purpose, sampling of corn, apple and tomato fields from depths of 0 to 20 cm in spring was done. After preparation of soil samples and culture of them in the culture medium, the bacteria were purified. The synthetic growth of bacteria showed that ZT12, ZT15 and ZT19 isolates were from 21 isolates of bacteria with the increase of herbicide, the highest growth was observed at 500 mg/l, and the most significant isolate of ZT15 was detected by optical density of, 0.8629. It was, also determined that higher concentrations of 500 mg/L reduced growth of ZT15 isolate. Results of biochemical experiments and sequence investigation of bacterial isolates by interior primer indicate that bacterial strain ZT12, ZT15 and ZT19 are a strain of Enterobacter cancerogenus, Klebsiella sp. and Staphylococcus sp., respectively. Results of tests to determine presence or absence of metribuzin degrading gene or plasmid genomes of three bacteria isolates showed that the gene had been isolated on the plasmid. Cultivation of herbicide-degrading bacterial strains for release in a polluted environment is considered as appropriate for bioremediation.علفکش متریبوزین از جمله تریازینهایی است که بهمدت طولانی در خاک باقیمانده و با انتقال به منابع آب و خاک موجب آلوده شدن و افزایش سمیت زیستی میشود. تجزیه میکروبی نقش اساسی در حذف علفکشهای گروه تریازین دارند. پژوهش حاضر با هدف جداسازی و شناسایی باکتریهای بومی توانمند در جذب علفکش متریبوزین در منابع خاک استان زنجان انجام شد. برای این منظور، نمونهبرداری از خاک مزارع ذرت، سیبزمینی و گوجهفرنگی از عمق صفر تا 20 سانتیمتری در فصل بهار انجام شد. پس از آمادهسازی نمونههای خاک و کشت آنها در محیطکشت، باکتریهای رشد یافته خالصسازی شدند. بررسی سینتتیک رشد باکتریها نشان داد که جدایههایZT12 ، ZT15 و ZT19 از بین 21 جدایه باکتری جداسازی شده، با افزایش مقدار علفکش تا 500 میلیگرم بر لیتر بیشترین رشد را داشته و ZT15 شاخصترین جدایه با جذب نوری 8629/0 شناسایی شد. غلظتهای بیشتر از 500 میلیگرم بر لیتر سبب کاهش رشد جدایه ZT15 شد. نتایج آزمایشهای بیوشیمیایی و توالییابی ژن <em>16S rRNA</em> نشان داد که باکتریهای ZT12، ZT15 و ZT19 بهترتیب سویههایی از باکتریهای جنس <em>Enterobacter cancerogenus</em>، <em>Klebsiella</em> sp. و <em>Staphylococcus </em>sp. هستند. نتایج بررسیهای انجام شده در خصوص حضور یا عدمحضور ژن <em>TrzA</em> برروی پلاسمید و ژنوم باکتری در هر سه جدایه نشان داد که این ژن بر روی پلاسمید باکتریها قرار دارد. با توجه به توانایی باکتریهای مقاوم شناسایی شده در این تحقیق، تلقیح جدایههای بومی تجزیهکننده علفکش و همچنین استفاده از خالصسازی و استخراج آنزیمهای تجزیهکننده آن جهت پالایش آلایندهها در محیطهای آلوده میتواند، مناسب باشد.https://ab.basu.ac.ir/article_2266_41c78ccb96d25d91b4c2ff0682f3dc9e.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522The Study on the Effect of Anther Orientation, Type and Composition of Culture Medium and Ovary Co-culture on Callus Induction from Cultured Anthers of Pumpkin (Cucurbita pepo var. Styriaca)مطالعه اثر جهت قرار دادن بساک، نوع و ترکیب محیطکشت و کشت توأم بساک با تخمدان روی القاء کالوس در کشت بساک کدوی تخم پوستکاغذی (Cucurbita pepo var. Styriaca)1932226710.22084/ab.2017.2267FAژالهمحسنی عراقیدانشجوی کارشناسی ارشد گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدانمحمدرضاعبداللهیدانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همداناصغرمیرزایی اصلاستادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان0000000000000000جوادحمزهئیدانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدانسید سعیدموسویاستادیار گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان0000-0002-3214-2703Journal Article20141129The production of doubled haploid cucurbit plants can accelerate the breeding programs of these species. In this research, anther culture of <em>Cucurbita pepo</em> var. styriaca was studied to produce callus and haploid embryos. Cytological studies showed that 15 mm male buds containing 9-10 mm anthers in size and microspores at mid to late-uninucleate were desirable for anther culture experiments. Three experiments were conducted as factorial based on completely Randomized Design (CRD) with three replications. In first experiment, the effect of anther orientation on culture medium as well as type and concentration of the plant growth regulators of NAA (0, 0.5 and 1 mgl<sup>-1</sup>) and 2,4-D (0, 1 and 2 mgl<sup>-1</sup>) on callogenesis percentage of pumpkin anther cultures were studied. Results showed that the culturing of anthers from convex side in a culture medium supplemented with 2 mgl<sup>-1</sup> 2,4-D and 1 mgl<sup>-1</sup> NAA resulted in the highest percentage of callogenesis. In second experiment, the interaction effects of medium type (B<sub>5</sub> and E<sub>20</sub>) and combination treatments of 2,4-D (0, 2.5 and 5 mgl<sup>-1</sup>) and BAP (0, 0.5 and 1 mgl<sup>-1</sup>) on callogenesis percentage were studied. E<sub>20</sub> culture medium supplemented with 2.5 mgl<sup>-1</sup> 2,4-D and 1 mgl<sup>-1</sup> BAP produced the highest percentage of callogenesis compared to other treatments. In third experiment, the effect of pumpkin and wheat ovary conditioned medium on callogenesis percentage from pumpkin anthers were studied in two E<sub>20</sub> culture media (Solid and liquid). In this experiment, co-culturing of pumpkin anthers with wheat ovaries in solid culture medium resulted in the highest percentage of callogenesis compared to other treatments. در این تحقیق، کشت بساک گیاه کدوی تخم پوستکاغذی (<em>Cucurbita</em> <em>pepo</em> var. Styriaca) بهمنظور تولید کالوس و جنین هاپلوئید بررسی شد. آزمایشات سیتوژنتیکی نشان داد که غنچههای 5/1 سانتیمتری حاوی بساکهای10-9 میلیمتری و میکروسپورهایی در مرحله تک هستهای میانی تا انتهایی برای کشت بساک مناسب بودند. سه آزمایش فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار اجرا گردید. در آزمایش اول، اثر جهت قرار دادن بساک بر روی محیطکشت و نوع و غلظت تنظیمکنندههاِی رشد گیاهی NAA (صفر، 5/0، 1 میلیگرم در لیتر) و 2,4-D (صفر، 1، 2 میلیگرم در لیتر) روی صفت درصد کالوسزایی بررسی شد. در این آزمایش کشت بساکها از جهت محدب در محیط حاوی 1 میلیگرم در لیتر NAA و 2 میلیگرم در لیتر 2,4-D، بیشترین درصد کالوسزایی را ایجاد کرد. در آزمایش دوم، اثرات متقابل نوع محیطکشت (E<sub>20</sub> و B<sub>5</sub>) و ترکیب تیمارهای هورمونی2,4-D (صفر، 5/2، 5 میلیگرم در لیتر) و BAP (صفر، 5/0، 1 میلیگرم در لیتر) بر صفت درصد کالوسزایی کدو مورد مطالعه قرار گرفت که محیطکشت E<sub>20</sub> حاوی 1 میلیگرم در لیتر BAP و 5/2 میلیگرم در لیتر 2,4-D، بیشترین درصد کالوسزایی را در مقایسه با تیمارهای دیگر ایجاد کرد. در آزمایش سوم اثر کشت توأم بساک کدوی تخم پوستکاغذی با تخمدان گندم و تخمدان کدو بر درصد کالوسزایی بساک کدو در دو نوع محیطکشت جامد و مایع E<sub>20</sub> بررسی شد. در این آزمایش کشت توأم بساک کدو و تخمدان گندم در محیطکشت جامد، نسبت به بقیه تیمارها بیشترین درصد کالوسزایی را نشان داد.https://ab.basu.ac.ir/article_2267_8c489561750e46fa85c91ef544a88734.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Cloning and Expression Pattern Analysis of Lipid Transfer Protein Gene from Wheat (Triticum aestivum) Responding to Septoria tritici Blotch (STB)بررسی الگوی بیان ژن کدکننده پروتئین انتقالدهنده چربی در مقابله با بیماری سپتوریوز برگی در گندم نان و کلونسازی آن3340226810.22084/ab.2017.2268FAمعصومهحبیبیدانشآموخته کارشناسیارشد گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکردندامیرآخورلیاستادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکردمحسنمردیدانشیار بخش زیستشناسی سامانهها، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرجJournal Article20130703Plant lipid transfer proteins, also known as plant LTPs, are a group of highly-conserved proteins of about 8-10kDa found in higher plant tissues. As its name implies, lipid transfer proteins are responsible for the shuttling of phospholipids and other fatty acid groups between cell membranes. Here we study the expression pattern of <em>Lipid transfer protein </em>gene from wheat (<em>Triticum aestivum</em>) responding to <em>Septoria tritici</em> Blotch (STB) by semi quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). This method is used to qualitatively detect gene expression in different cells. level of <em>LTP2</em> gene expression was measured over time, from 0h to 6 days after inoculation in Wangshuibai as a resistant wheat cultivar and Falat as a sensitive one. The results showed that inoculation of wheat by <em>M. graminicola </em>(asexual stage<em>: Septoria tritici) </em>cause different level of <em>LTP2</em> gene expression in both resistant and susceptible cultivars over time. The pattern of gene expression indicated that <em>LTP2</em> gene is an early expression gene in resistant cultivar and induced at 24h after inoculation and in sensitive cultivare the high level expression have been seen at 6 days after inoculation. Thus, according this results can be concluded that these genes, along the main genes, increase and maintain resistance to <em>Septoria tritici</em> blotch in wheat. In this study we cloned <em>LTP2 </em>genes from both cultivars and after sequencing the blast protein was studied. Blast results confirmed that these proteins contain eight cysteines that are conserved in all LTP peptides.پروتئینهای انتقالدهنده چربی (LTP)، در حدود 10-7 کیلودالتون وزن داشته و بهدلیل توانایی که در انتقال انواع مولکولهای فسفولیپید از محل سنتز (شبکه آندوپلاسمی) به غشاهای سلولی دارند، به این نام خوانده میشوند. در این مطالعه نقش این پروتئینها در ایجاد مقاومت گندم نان نسبت به بیماری سپتوریوز برگی (<em>Septoria tritici</em>) با بررسی الگوی بیان ژن<em>LTP2 </em> طی 6-0 روز بعد از آلودگی در رقم مقاوم ونگشوبایی و حساس فلات با استفاده از روشRT-PCR نیمهکمی بررسی گردید. از آنجا که این روش امکان مقایسه نسبی مقدار رونوشت ژنها را در انواع سلولهای مختلف فراهم مینماید مطالعهی الگوی بیان ژن به سادگی ممکن میگردد. که طی آن علاوهبر میزان بیان، زمان بیان ژن نیز مورد بررسی قرار میگیرد. نتایج این تحقیق نشان داد که میزان بیان ژن در اثر آلودگی گیاه با بیماری سپتوریوز برگی در هر دو رقم حساس و مقاوم افزایش مییابد. بیان این ژن در رقم مقاوم طی 24 ساعت بعد از آلودگی افزایش مییابد درحالیکه این افزایش بیان در رقم حساس با تأخیر و بعد از شش روز مشاهده میشود. با توجه به نتایج حاصل میتوان گفت این ژن با ایجاد مقاومت علیه بیماری سپتوریوز برگی مرتبط بوده و در کنار ژنهای اصلی ایجادکننده مقاومت باعث تشدید و حفظ مقاومت خواهد شد. همچنین ژن پس از کلونسازی، تعیین توالی گردید و مورد بررسی بلاست پروتئینی قرار گرفت. با بررسی نتایج بلاست مشخص گشت که توالی کلون شده دارای هشت سیستئین ثابت و حفاظت شده است که در همه پروتئینهای انتقالدهنده چربی ثابت میباشد.https://ab.basu.ac.ir/article_2268_bc2e2478c49ae5920bdb09f268ebd782.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Optimization of In Vitro Propagation of Alstroemeria by Apical Bud Culture, Callus Induction and Plant Regenerationبهینهسازی تکثیر درونشیشهای آلسترومریا با استفاده از کشت جوانه انتهایی، القاء کالوس و باززایی گیاه4151226910.22084/ab.2017.2269FAفردیننصریدانشجوی دکتری گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشتیاوروفاییاستادیار گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندجعلی اکبرمظفریاستادیار گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندجسید نجم الدینمرتضویدانشیار گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجانJournal Article20141030This research was conducted at two different experiments to optimization of in vitro propagation Alstroemeria. Experiment 1: effect of BAP (0, 0.5, 1, 1.5 and 2 mg/l<sup>-1</sup>) and IBA (0, 0.1 and 0.2 mg/l<sup>-1</sup>) on apical buds (0.8-1 cm) grown from young’s shoots tips of Alstroemeria c.v. Fujie and experiment 2: effect of 2,4-D (0, 1, 2, 4, 6 and 8 mg/l<sup>-1</sup>), picloram (0, 1, 2, 4, 6 and 8 mg/l<sup>-1</sup>) and BAP (0 and 0.5 mg/l<sup>-1</sup>) were studied on embryonic callus induction from first seedling leaves in A. ligtu hybrid. The MS medium was used in both experiments. At experiment 1: the highest shoots number was obtained in 1 mg.l<sup>-1</sup> BAP+0.1 mg.l<sup>-1</sup> IBA (4.27). The results showed that increasing of BAP concentration caused decreasing of shoot and internode length due to apical dominant decreasing via IBA effect. The highest root number (3.25) was obtained in 0.2 mg.l<sup>-1</sup> IBA concentration without BAP and the highest rhizome number was recorded at 1 mg/l<sup>-1</sup> BAP without IBA (3.5). At experiment 2: maximum of compact embryonic callus (29.13%) was obtained with 2 mg/l<sup>-1</sup> picloram and 0.5mg/l<sup>-1</sup> BAP, followed by 2 mg/l<sup>-1</sup> 2,4-D and 0.5 mg/l<sup>-1</sup> BAP. To callus proliferation, both types of callus were maintained on MS with 4 mg/l<sup>-1</sup> picloram.این پژوهش در دو آزمایش متفاوت جهت بهینهسازی تکثیر درونشیشهای آلسترومریا انجام شد. آزمایش اول: اثر بنزیل آمینوپورین (BAP) (صفر، 5/0، یک، 5/1و دو میلیگرم در لیتر) و ایندول بوتیریک اسید (IBA) (صفر، 1/0 و 2/0 میلیگرم در لیتر) روی جوانههای انتهایی (1-8/0 سانتیمتر) رشد یافته از نوک شاخههای جوان رقم فوجی (Fuji) و آزمایش دوم: اثر 2,4-D (صفر، یک، دو، چهار، شش و هشت میلیگرم در لیتر)، پیکلورام (صفر، یک، دو، چهار، شش و هشت میلیگرم در لیتر) و BAP (صفر و 5/0 میلیگرم در لیتر) روی القاء کالوس جنینی از برگهای اولیه گیاهچه در گونه لیگتو بررسی شد. در هر دو آزمایش محیطکشت MS استفاده شد. در آزمایش اول: بالاترین تعداد شاخهها در یک میلیگرم در لیتر BAP + 1/0 میلیگرم در لیتر IBA بهدست آمد (27/4). نتایج نشان داد که افزایش غلظت BAP باعث کاهش طول شاخساره و میانگره شد که میتواند به سبب کاهش غالبیت انتهایی حاصل از اثر IBA باشد. بالاترین تعداد ریشه (25/3) در غلظت 2/0 میلیگرم در لیتر IBA بدون BAP و بالاترین تعداد ریزوم (5/3) در محیطکشت حاوی یک میلیگرم در لیتر BAP و بدون IBA بهدست آمد. در آزمایش دوم: حداکثر کالوس جنینی متراکم (13/29 %) با دو میلیگرم در لیتر پیکلورام و 5/0 میلیگرم در لیتر BAP، سپس توسط دو میلیگرم در لیتر 2,4-D و 5/0 میلیگرم در لیتر BAP بهدست آمد. جهت پرآوری کالوس، هر دو نوع کالوس روی MS همراه با 4 میلیگرم در لیتر پیکلورام نگهداری شدند.https://ab.basu.ac.ir/article_2269_aecde21098e635c48d83faf3c89eedf4.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Replacement Biotechnology Instead of Chemical Methods to Converse Chitin Into Chitosanجایگزینی فنآوری زیستی بهجای روشهای شیمیایی در تبدیل کیتین به کیتوزان5358227010.22084/ab.2017.2270FAیوسفعلیاسدپور اوصالواسـتادیار، بخش زیست فناوری مـرکز تحقـیقـات آرتمیای کشـور، مؤسـسه تحقیقات علوم شـیـلاتی کشور، سـازمـان تحقیـقات، آمـوزش و ترویج کـشاورزی، ایرانJournal Article20150818Chitin and chitosan are two very important biopolymer products that have so many usages in the high cost industries. Chitin Converts into chitosan via de-acetylation of chitin. It occurs by alkaline melting method in the absence of oxygen. Chemical structure change, severe environmental pollution and De-polymerization are of the major problems in producing high quality chitosan. In this study for conversion of chitin into chitosan fungus <em>Aspergillus niger</em> strains (ATHUM-10864), the generator of de-acetylases enzymes were used instead of chemicals. Chitosan quality was determined via elemental analysis infrared spectroscopy, X-ray tomography, molecular weight determination and estimation of crystallinity percent, color and molecular structure.The results showed 80±5% efficiency in the conversion of chitin into chitosan or de-acetylation degree of chitin. The gained chitosan contained of 44.4% carbon, 8.9% nitrogen, 2.7% hydrogen and 39.5% oxygen. The physical characteristics were as 94.5% Crystallinity and pale brown color. The chemical structure of per unit of chitosan was obtained as C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>NO<sub>4</sub>. The results showed that replacing biological methods instead of chemicals was possible to access well quality products. It also eliminates the use of chemical materials such as concentrate sodium hydroxide that is damaging the environment.کیتین وکیتوزان دو فرآورده بسیار مهم از پلیمرهای زیستی هستند که در صنایع مصارف بسیار بالایی در صنایع ارزشمند دارند. تبدیل کیتین به کیتوزان با روش استیلزدایی و به شیوه ذوب قلیایی است که بدون حضور اکسیژن انجام میشود. تغییر ساختار شیمیایی، آلودگی شدید محیطزیست و دپلیمریزاسیون از مشکلات اساسی در صنعت تولید کیتوزان با کیفیت بالا میباشند. در این پژوهش برای تبدیل کیتین به کیتوزان بهجای مواد شیمیایی از قارچ<em> آسپرژیلوس</em> <em>نایجر</em> سویه (ATHUM-10864)، مولد آنزیم داستیلاز استفاده شد. کیفیت کیتوزان با آنالیزهای تجزیه عنصری دستگاه طیفسنجی مادون قرمز، پرتونگاری با اشعه ایکس، تعیین وزن مولکولی، درصد بلوری شدن، رنگ و ساختار مولکولی مشخص شد. نتایج نشان داد که بازده تبدیل کیتین به کیتوزان یا بهعبارتی درجه استیلزدائی، در این روش 5±80 درصد است. کیتوزان حاصل دارای 4/44 درصد کربن، 9/8 درصد نیتروژن، 2/7 درصد هیدروژن و 5/39 درصد اکسیژن بود. مختصات فیزیکی آن شامل درصد بلورینگی 5/94 و رنگ آن قهوهای کمرنگ بود و ساختارشیمیایی هر واحد کیتوزان بهصورت (C<sub>6</sub>H<sub>12</sub>NO<sub>4</sub>) بهدست آمد. نتایج نشان داد که جایگزینی روشهای زیستی بهجای شیمیایی در دستیابی به این فرآورده با کیفیت مناسبی امکانپذیر بوده و موجب حذف استفاده از مواد شیمیایی مخرب محیطزیست نظیر هیدروکسیدسدیم غلیظ میشود.https://ab.basu.ac.ir/article_2270_6cde5231c1c3957d9145ed97a7021c2f.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Genetic Diversity Analysis of Four Sheep Breeds Existing in Iran Using Microsatellite Markersبررسی تنوع ژنتیکی چهار نژاد از گوسفندان موجود در ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهوارهای5966227110.22084/ab.2017.2271FAمحمدتقیواجدابراهیمیدانشآموخته کارشناسیارشد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمانمحمدرضامحمدآبادیاستاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمانعلیاسماعیلی زادهاستاد گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمانJournal Article20160523Considering the importance of identification and maintaining of genetic diversity in native animals, four sheep breeds existing in Iran (Pakistani (25), Kermani (102), Iran Black (44) and Lory-Bakhtiyari (25)) were evaluated in terms of genetic diversity, using four microsatellite markers McMA2, HSC, OarHH35 and BM6444. Genomic DNA was extracted from 196 blood samples by optimized salting-out DNA extraction procedure and PCR was performed using four primer pairs. The results showed that all loci are polymorph. Hardy-Weinberg equilibrium using chi-square test showed that some of the various components of loci - population were in Hardy-Weinberg disequilibrium (P<0.05). The highest number of alleles were observed for HSC of Pakistani population (14 alleles) and the lowest number of alleles were in HSC in Kermani and IranBlack populations (7 alleles). The polymorphic information content (PIC) of McMA2, HSC, OarHH35 and BM6444 were 0.9, 0.87, 0.87 and 0.86 respectively. In general, it can be concluded that all studied sheep populations have wide genetic diversity based on studied loci.با توجه به اهمیت شناسایی و حفظ تنوع ذخایر ژنتیکی کشور، چهار جمعیت از نژادهای گوسفند موجود در ایران (پاکستانی (25 رأس)، کرمانی (102 رأس)، ایرانبلک (44 رأس) و لریبختیاری (25 رأس)) با استفاده از 4 نشانگر ریزماهوارهای (McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444) از نظر تنوع ژنتیکی بررسی شدند. استخراج DNA ژنومی از تعداد 196 نمونه خون به روش نمکی بهینه شده، انجام شد و واکنشهای PCR با استفاده از چهار جفت آغازگر اجرا شد. نتایج نشان داد که تمامی جایگاهها چندشکل هستند. تعادل هاردی- واینبرگ به روش آزمون مربع کای نشان داد که برخی ترکیبات مختلف جایگاهها- جمعیت در حالت عدم تعادل قرار داشتند (05/0>P). بیشترین تعداد آلل مشاهده شده مربوط به جایگاه HSC در جمعیت پاکستانی (14 آلل) و کمترین تعداد نیز از آن جایگاه HSC در جمعیتهای کرمانی و ایرانبلک (7 آلل) بود. حداکثر محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) در حالت ترکیب جمعیت- جایگاه برای جایگاههای McMA2، HSC، OarHH35 و BM6444 بهترتیب 9/0، 87/0، 87/0 و 86/0 بودند. در مجموع میتوان نتیجه گرفت که جمعیتهای گوسفند مورد بررسی در این تحقیق با توجه به جایگاههای مورد مطالعه، از تنوع ژنتیکی نسبتاً بالایی برخوردارند.https://ab.basu.ac.ir/article_2271_b4e7fbc8d408fadbf104f47e0b341596.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Identification of Fusarium Species Isolated from Crude Oil Contaminated Soils in Oil Refinery in Kermanshah Provinceشناسایی گونههای فوزاریوم قابل رشد در خاکهای آلوده به نفت در پالایشگاه نفت در استان کرمانشاه با استفاده از روشهای ریختشناسی و مولکولی6774227210.22084/ab.2017.2272FAخسروچهریاستادیار گروه زیستشناسی، دانشکده علوم دانشگاه رازی کرمانشاه، کرمانشاه0000-0003-1352-9002الهامحیدریاندانشجوی کارشناسیارشد میکروبیولوژی دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم تحقیقات کردستان، سنندج، ایراندوستمرادظفریدانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدانJournal Article20160525Members of <em>Fusarium </em>species are common Fungi that can metabolize of petroleum hydrocarbons in entire the world. These fungi are resistant in oil contaminated sites.Therefore, the objectives in this study were to isolate and identify of <em>Fusarium </em>spp. from oil-contaminated soils in oil refinery in Kermanshah province based on the morphological and molecular characteristics. Crude oil contaminated soil samples were collected from crude oil contaminated soils in oil refinery in Kermanshah province.<em> Fusarium</em> spp. was isolated using peptone pentachloronitrobenzene agar (PPA) plates supplemented with streptomycin and neomycin. In this research 30 <em>Fusarium</em> strains were isolated. Based on morphological characters, all isolates belonged to <em>F. </em><em>falciforme</em>, <em>F. keratoplasticum</em>, and <em>F. petroliphilum</em> which belonged to <em>Fusarium solani </em>species complex. Based on the sequence data from ITS rDNA analysis, <em>Fusarium</em> isolates were divided into three major groups. Although the data obtained from morphological and molecular studies sufficiently supported each other, the resulting phylogenetic trees based on ITS rDNA dataset clearly distinguished closely related species and distinctly separated all morphological taxa. All the <em>Fusarium </em>spp. related from oil-contaminated soils was reported for the first time in Iran. Existing of fungi particularly <em>Fusarium</em> species in crude oil soils shows the probability of degradation and consumption of oil contaminated by these fungi. گونه<em></em>های فوزاریوم ازجمله قارچ<em></em>های تجزیهکننده ترکیبات نفتی در دنیا هستند. گونه<em></em>های فوزاریوم در مناطق آلوده به نفت پایدار هستند. بنابراین هدف از انجام این تحقیق شناسایی گونه<em></em>های فوزاریوم مرتبط با ترکیبات نفتی در پالایشگاه نفتی کرمانشاه با استفاده از روش<em></em>های ریخت<em></em>شناسی و مولکولی بود. نمونهها از خاکهای آغشته به ترکیبات نفتی موجود در محل خروج فاضلاب پالایشگاه نفت کرمانشاه جمعآوری شد. برای جداسازی گونه<em></em>های فوزاریوم از خاک از محیطکشت پپتون پنتاکلرونیتروبنزن-آگار همراه با استرپتومایسین و نئومایسین استفاده شد. در این تحقیق 30 جدایه قارچ جداسازی شد که بر اساس بررسیهای ریختشناسی سه گونه قارچی شناسایی شد که شامل گونه<em></em>های <em>Fusarium falciforme</em>، <em>F. petroliphilum</em> و <em>F. keratoplasticum</em> متعلق به کمپلکس گونه<em></em>ای <em>F. </em><em>solani</em> بودند. مطالعات مولکولی بر اساس مقایسه توالی نواحی آی تی اس ریبوزومی (<em>ITS rDNA</em>)، همه گونه<em></em>های فوزاریوم شناسایی شده را در سه گروه فیلوژنتیکی قرار گرفتند و بدین ترتیب مطالعات ریخت<em></em>شناسی نیز تایید شدند و گونه<em></em>های نزدیک هم تشخیص داده شدند. در این تحقیق همه گونه<em></em>ها برای اولین بار از ترکیبات نفتی در ایران گزارش می<em></em>شوند. قارچ<em></em>ها به<em></em>ویژه گونه<em></em>های فوزاریوم در محیط<em></em>های حاوی ترکیبات هیدروکربنی به راحتی رشد می<em></em>کنند. وجود گونه<em></em>های فوزاریوم در خاک<em></em>های نفتی احتمال تجزیه و مصرف هیدروکربن<em></em>های نفتی توسط این قارچ<em></em>ها را می<em></em>رساند.https://ab.basu.ac.ir/article_2272_cfb2708fa0a2ea4bec5d2ea985eeae24.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Designing, Construction and Functional Analysis of Two New Plant Expression Vectors (pBI121GUS-9 and pBI1213+4) with Improved Cloning Sitesطراحی، ساخت و بررسی کارآیی دو ناقل بیانی گیاهی (pBI121GUS-9 و pBI1213+4) با جایگاههای همسانهسازی توسعه یافته7584227310.22084/ab.2017.2273FAمحمدبهزادمنددانشآموخته کارشناسی ارشد گروه زیست فرآوردههای گیاهی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهرانکسریاصفهانیاستادیار گروه زیست فرآوردههای گیاهی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران0000-0003-3079-7009علی هاتفسلمانیاناستاد گروه زیست فرآوردههای گیاهی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهرانامیرموسویدانشیار گروه زیست فناوری مولکولی گیاهی، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهرانJournal Article20160605Most popular binary vectors used in plant transformation via Agrobacterium have limeted common restriction recognition sites due to large vector size which has caused difficulties in cloning of target genes. To overcome this problem, new plant expression vectors including pBI121<sup>3+4</sup> with three additional recognition sites downstream of <em>gus</em> gene and pBI121<sup>GUS-9</sup> with nine recognition sites between CaMV 35S and Nos terminator (by using two primers designed upstream and downstream of Nos terminator in a PCR reaction) were constructed and identified. To analyze the efficiency of new vectors both in cloning and transformation steps, <em>gus</em> reporter gene was cloned and the new recombinant constructs were transferred to model plant <em>Nicotiana tabbacum</em> L. cv. Samsun via <em>Agrobacterium tumefaciens </em>(LBA4404). DNA was extracted from putative transgenic seedlings, which were regenerated on selective media and analyzed by PCR method. GUS assay confirmed the expression of the transgene in leaves of transgenic seedlings. After verification of the pBI121<sup>3+4</sup> and pBI121<sup>GUS-9</sup> in transformation and expression of the reporter gene, these vectors can be used for transformation of strategic plants with commercial transgenes.اکثر ناقلین دوتایی متداول در تراریختی گیاهان به واسطه آگروباکتریوم، بهدلیل اندازه بزرگ، دارای تعداد اندکی جایگاه شناسایی منحصر به فرد آنزیمهای برشی شناخته شده و متداول میباشند که این موضوع همسانهسازی ژنهای موردنظر را در آنها با مشکل مواجه میکند. برای رفع این مشکل ناقل pBI121<sup>3+4</sup>،با سـه جایگـاه برشی منـحصر به فـرد جدید نسبت به ناقـل pBI121 در پاییندست ژن گزارشگر <em>gus</em> (β-glucuronidase) و همچنین ناقل pBI121<sup>GUS-</sup><sup>9</sup>، دارای نه جایگاه منحصر به فرد آنزیمهای برشی بین پیشبر CaMV 35S و خاتمهدهنده NOS (با طراحی دو آغازگر یکی در بالا دست و دیگری پایین دست خاتمهدهنده NOS و استفاده از آنها در یک واکنش PCR)، ساخته و معرفی شدند. برای بررسی کارآیی ناقلین جدید، هم در مرحله همسانهسازی و هم در مرحله انتقال ژن به گیاه، ابتدا ژن گزارشگر <em>gus</em> در داخل این ناقلین همسانهسازی و سپس سازههای نوترکیب حاصل به گیاه مدل توتون رقم سامسون منتقل شدند. کارآیی ناقلین جدید، پس از استخراج DNA ژنومی از گیاهان تراریخته حاصل از دانهالهای رشد یافته در محیطکشت انتخابی، ابتدا با انجام PCR جهت تأیید تلفیق تراژن و سپس آزمون سنجش فعالیت GUS با استفاده از روش هیستوشیمیایی برای تأیید بیان مؤثر ژن منتقل شده، ارزیابی شد. آنالیزهای مولکولی، حضور تراژن و بیان آن را در گیاهان تراریخته تأیید کردند. با تأیید کارآیی ناقلین pBI121<sup>GUS-9</sup> و pBI121<sup>3+4</sup>در انتقال ژن گزارشگر و بیان مؤثر آن، میتوان از آنها برای انتقال ژنهای تجاری به گیاهان استراتژیک استفاده کرد.https://ab.basu.ac.ir/article_2273_c1f53c10bf4065ec143d020944b0d584.pdfدانشگاه بوعلی سینادوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)2476-63138120170522Evaluation Diversity of some Center and South Iranian Onion (Allium cepa L.) Genotypes for Bolting Resistance and It`s Relationship with SSR Markerارزیابی تنوع برخی از ژنوتیپهای پیاز جنوب و مرکز ایران از نظر مقاومت به بولتینگ و ارتباط آن با نشانگر مولکولی SSR8592227410.22084/ab.2018.8370.1267FAاسدمعصومی اصلاستادیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوجسیده مریمزریندانشجوی کارشناسیارشد، گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوجمسعوددهداریدانشیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوجرضاامیری فهلیانیاستادیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوجJournal Article20151008Flowering branches formation in bulb production time were reduced the quality and quantity of product. Thus, study how this phenomenon for identifying bolting resistant genotypes is important. To evaluate diversity of some center and south Iranian onion genotypes in respect to flower production, 16 accessions of Iranian onions seeds (6 genotype received from Iranian Gene bank and 10 local accessions were collected from different regions of the center and south of the country) as well as two foreign cultivars were planted in the pots and in stage of eight leaves, were treated during 45 and 70 day. From 12 SSR primers, only 10 primers can produced right bands. The average polymorphic Information Content (PIC), observed and expected heterozygosity were 0.38, 0.49 and 0.59, respectively. Cluster analysis based on molecular data using Jaccard's similarity coefficient and UPGMA method, classified the evaluated genotypes in six groups. The results of binary logistic regression showed that some of SSR markers are linked to morphological and physiological characteristics.تشکیل ساقه گلدهنده در زمان تولید سوخ پیاز، کیفیت و کمیت محصول را کاهش میدهد. بنابراین، مطالعه نحوه بروز این پدیده جهت شناسایی ژنوتیپهای مقاوم به بولتینگ مهم است. با هدف بررسی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپهای پیاز مرکز و جنوب ایران از جهت گلدهی، بذور 16 ژنوتیپ پیاز بومی ایران (6 ژنوتیپ دریافتی از بانک ژن ملی ایران و 10 ژنوتیپ جمعآوری شده از نواحی مختلف جنوب و مرکز کشور) به همراه دو رقم خارجی در گلدان کشت و در مرحله هشت برگی، به مدت 45 و 70 روز تحت تیمار دمایی قرار گرفتند. از 12 آغازگر ریزماهواره فقط 10 آغازگر باندهای قابلقبولی تولید کردند. متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC)، 38/0 و میانگین هتروزیگوسیتی مشاهدهشده و موردانتظار بهترتیب 49/0 و 41/0 بودند. تجزیه خوشهای براساس دادههای مولکولی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA، ژنوتیپهای مورد بررسی را در شش گروه قرار داد. نتایج حاصل از رگرسیون لجستیک نیز نشان داد که بین برخی آللها با ویژگیهای مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی مرتبط با بولتینگ پیوستگی وجود دارد.https://ab.basu.ac.ir/article_2274_612582c262a5fd3b61845cbdd372cffe.pdf