شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های Botrytis cinerea عامل کپک خاکستری توت‌فرنگی در استان کردستان

نوع مقاله: علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 دانش‌آموخته بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی‌سینا، همدان

2 . دانشیار، گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی‌سینا، همدان

3 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج

چکیده

     تعداد 19 جدایه‌بوتریتیس از توت‌فرنگی­‌های دارای علائم بیماری کپک خاکستری از مزارع و گلخانه‌ کشت هیدروپونیک توت‌فرنگی از استان کردستان جمع­آوری شدند. جدایه­ها براساس خصوصیات مورفولوژیکی به‌عنوان گونه  Botrytis cinerea Pers.: Fr., تشخیص داده شدند. به‌منظور تأیید و شناسایی بیشتر گونه موردنظر به روش مولکولی از آغازگرهای اختصاصی C729 استفاده شد. جدایه­های مورد بررسی با انجام PCR با آغازگر اختصاصی و تکرار آزمایش باند 700 جفت‌بازی مختص گونه را تکثیر کردند. تنوع ژنتیکی جدایه‌های موجود با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD مورد بررسی قرار گرفت. براساس نتایج به‌دست آمده از مطالعه تنوع ژنتیکی، جدایه‌ها در چهار گروه اصلی قرار گرفتند. با توجه به نحوه‌ی گروه­بندی جدایه­ها، در نگاه اول مشاهده شد که گروه جدایه­های گلخانه از گروه جدایه­های مزارع مختلف تفکیک شدند اما برخی جدایه­ها از این الگو پیروی نکرده و متفاوت بودند. همچنین در بررسی جدایه­های مزارع حومه استان و ارتباط آنها با یکدیگر، ارتباط مشخصی بین نزدیکی جدایه­ها از لحاظ جغرافیایی و خصوصیات ژنتیکی و الگوی RAPD آنها با هم وجود نداشت بلکه بعضاً مشاهده شد که برخی جدایه­های دور از هم از لحاظ جغرافیایی شباهت بیشتری به همدیگر، نسبت به جدایه­های جمع‌آوری شده از مزارع نزدیک به هم داشتند.
 

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Identification and Study of Genetic Diversity of Botrytis cinerea Isolates Caused Strawberry Grey Mold in Kurdistan Province

نویسندگان [English]

  • saghi Younesi Bane 1
  • mohammad javad soleimani 2
  • dostmorad zafari 2
  • bahman bahramnezhad 3
چکیده [English]

Total of nineteen isolates of Botrytis sp. were collected from infected strawberry plants of hydroponic cultivated greenhouse and fields surround kurdistan province. According to the morphological characteristics, isolates were identified as Botryits cinerea species. For confirming the species identification by molecular method specific primers C729 were used and PCR test repeated twice. The results showed that these isolates amplified the 700 bp band which is specific for this species. Genetic diversity of existing isolates was investigated by RAPD analysis. According to the results obtained, isolates were clustered into four groups. Considering this clustering mode, in first glance, most of the greenhouse isolates were grouped together and separated from the group of field isolates, but some of them didn’t follow the pattern and were divided differently. Likewise, study among field isolates collected surround the province and their relationships, showed that there is no correlation between molecular clustering and geographical origin of these isolatesو but also it was clear that some of the geographically further isolates were more similar to each other rather than isolates from closer geographical regions.
 

کلیدواژه‌ها [English]

  • Botrytis cinerea
  • Specific primer
  • PCR
  • Genetic diversity
  • RAPD
Alfonso, C., Raposo, R. and Melgarejo, P. 2000. Genetic diversity in Botrytis cinerea population on crops in greenhouses in south-eastern Spain. Plant Pathology, 49: 243-251.

Amin, Sh., Morid, B., Rezaee, S. and Haj Mansoor, Sh., 2012. Investigation on transposable elements frequency in Botrytis cinerea isolates in Iran, 20 Plant Protection Congress.

Ellis, MB. 1971. Dematiaceus, Hyphomycetes. Common wealth mycological institute, 178-184.

Jarvis, WR. 1977. Botryotinia and Botrytis Species: Taxonomy, Physiology, and Pathogenicity. Research Branch, Canada Department of Agriculture, Ottawa, Canada.

Kerssies, A. and Bosker-van Zessen, A. I., 1997. Variation in pathogenecity and DNA polymorphism among Botrytis cinerea isolates sampled inside and outside a glasshouse. Plant Disease, 81: 781-786.

Menzinger, W. 1966. Zur variabilitat und taxonomie von arten und formen der gattung Botrytis mich. I. untersuchungen zur kulturbedingten variabilitat morphologischer eigenschaften von formen der gattung Botrytis. Aus dem Institute für pflanzenkrankheiten und pflanzenschutz der technischen hochschule hannover. Zentralbl Bakteriol Parasitenkd Infektionskr Hyg, 120: 141-178.

Mirzaei, S., Mohammadi Goltapeh, E. and Shams-bakhsh, M. 2008. Identification of Botrytis spp. on plants grown in Iran. Phytopathology, 156: 21-28.

Mirzaei, S., Mohammadi Goltapeh, E. and Shams-bakhsh, M. 2009. Genetic and phenotypic diversity of Botrytis cinerea isolates in Iran. Phytopathology, 157: 474-482.

Moyano, C., Alfonso, C., Gallego, J., Raposo, R. and Melgarejo, P. 2003. Comparison of RAPD and AFLP marker analysis as a means to study the genetic structure of Botrytis cinerea populations. European Journal of Plant Pathology, 109: 515-522.

Murray, M. G. and Thompson, W. F. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA. Nucleic Acid Research, 8: 4321-4325.

Nielsen, K., Justesen, AF., Jensen, DF. and Yohalem, DS. 2001. Universally primed polymerase chain reaction alleles and internal transcribed spacer restriction fragment length polymorphisms distinguish two subgroups in Botrytis aclada distinct from B. byssoidea. Phytopathology, 91: 527-533.

Rigotti, S., Viret, O. and Gindro, K. 2006. Two new primers highly specific for detection of Botrytis cinerea Pers.: Fr. Phytopathology. Meditterranea, 45: 253-260.

Rohlf, FJ. 1998. NTSYS pc Version 2.0: User Guide. Applied Biostatistics Inc. Phylogeny Analysis using NTSYS-pc.

Thompson, J. R. and Latorere, B. A. 1999. Characterization of Botrytis cinerea from table grape in Chile using RAPD-PCR. Plant Disease, 83(12).

Utkhede, RS. and Mathur, S. 2002. Biological control of stem canker of greenhouse tomatoes caused by Botrytis cinerea. Canadian Journal of Microbiology, 48: 550-554.

Vander Vlugt Bergmans, C. J. B., Brandwagt, B. F., Van't klooster, J. W., Wagemakers, C. A. M. and Van kan, J. A. L. 1993 Genetic variation and segregation of DNA polymorphism in Botrytis cinerea. Mycological Research, 97: 1193-1200.

Zadehdabagh, Gh., Kiani, Sh., Alizadeh, A. and Rokni, N. 1998. Evaluation virulence of Botrytis cinerea isolates collected from Iran's different regions on the cut flower rose in greenhouse condition.18th Plant Protection Congress.