ارزیابی تنوع برخی از ژنوتیپ‌های پیاز جنوب و مرکز ایران از نظر مقاومت به بولتینگ و ارتباط آن با نشانگر مولکولی SSR

نوع مقاله: علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج

2 دانشجوی کارشناسی‌ارشد، گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج

3 دانشیار گروه اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج

چکیده

تشکیل ساقه گل‌دهنده در زمان تولید سوخ پیاز، کیفیت و کمیت محصول را کاهش می‌دهد. بنابراین، مطالعه نحوه بروز این پدیده جهت شناسایی ژنوتیپ‌های مقاوم به بولتینگ مهم است. با هدف بررسی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپ‌های پیاز مرکز و جنوب ایران از جهت گل‌دهی، بذور 16 ژنوتیپ پیاز بومی ایران (6 ژنوتیپ دریافتی از بانک ژن ملی ایران و 10 ژنوتیپ جمع‌آوری شده از نواحی مختلف جنوب و مرکز کشور) به همراه دو رقم خارجی در گلدان کشت و در مرحله هشت برگی، به‌ مدت 45 و 70 روز تحت تیمار دمایی قرار گرفتند. از 12 آغازگر ریزماهواره فقط 10 آغازگر باندهای قابل‌قبولی تولید کردند. متوسط محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC)، 38/0 و میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده‌شده و موردانتظار به‌ترتیب 49/0 و 41/0 بودند. تجزیه خوشه‌ای براساس داده‌های مولکولی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA، ژنوتیپ‌های مورد بررسی را در شش گروه قرار داد. نتایج حاصل از رگرسیون لجستیک نیز نشان داد که بین برخی آلل‌ها با ویژگی‌های مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی مرتبط با بولتینگ پیوستگی وجود دارد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Evaluation Diversity of some Center and South Iranian Onion (Allium cepa L.) Genotypes for Bolting Resistance and It`s Relationship with SSR Marker

نویسندگان [English]

  • Asad Masoumiasl 1
  • Seyede Maryam Zarrin 2
  • Masoud Dehdari 3
  • Reza Amiri-Fahliani 1
1 Assistant Professor, Department of Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Yasouj University, Yasouj
2 MSc Student, Department of Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Yasouj University, Yasouj
3 Associate Professor, Department of Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Yasouj University, Yasouj
چکیده [English]

Flowering branches formation in bulb production time were reduced the quality and quantity of product. Thus, study how this phenomenon for identifying bolting resistant genotypes is important. To evaluate diversity of some center and south Iranian onion genotypes in respect to flower production, 16 accessions of Iranian onions seeds (6 genotype received from Iranian Gene bank and 10 local accessions were collected from different regions of the center and south of the country) as well as two foreign cultivars were planted in the pots and in stage of eight leaves, were treated during 45 and 70 day. From 12 SSR primers, only 10 primers can produced right bands. The average polymorphic Information Content (PIC), observed and expected heterozygosity were 0.38, 0.49 and 0.59, respectively. Cluster analysis based on molecular data using Jaccard's similarity coefficient and UPGMA method, classified the evaluated genotypes in six groups. The results of binary logistic regression showed that some of SSR markers are linked to morphological and physiological characteristics.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Polymerase Chain Reaction
  • Cluster analysis
  • Flowering
  • Logistic regression

Abdollahi-Sisi, N., Mohammadi, S. M., Alavi-kia, S. S. and Sadeghzadeh, B. 2012. Efficiency of EST-SSR markers in determination genetic diversity and relationships of barley landraces. Cereal Research, 93:123-133.

Ahmadi Mashgeneni, F., Nasr Esfahani, M. and Ebrahimi, M. A. 2014. Genetic diversity of Iranian onion genotypes using RAPD marker. Advanced Genetic Journal, 10(2): 299-303. 

Alemzadeh-Ansari, N. 2009. Onion. First edition. Shahid Chamran University Publication. 238pp.

Anderson, B. and McDonald, G. 1993. Construction of DNA libraries of A-T rich organisms using EcoRI star activity. Annual Review of Biochemistry, 211: 325-327.

Brewster, J. L. 1982. Flowering and seed production in overwintered cultivars of bulb onion. II. Quantitative relationships between mean temperatures and day lengths and the rate of inflorescence development. Journal of Horticultural Science, 57: 103-108.

Brewster, J. L. 1985. The influence of seedling size and carbohydrate status and of photon flux density during vernalization on inflorescence initiation in onion (Allium cepa L.). Annuals of Botany, 55: 403-414.

Chen, Z. W., Lu, R. J., Zou, L., Du, Z. Z., Gao, R. H., He, T. and Huang, J. H. 2012. Genetic diversity analysis of barley landraces and cultivars in the Shanghai region of China. Genetic and Molecular Research, 11: 644-650.

Dannequin, L. T. M., Panaud, O., Robert, T. and Ricroch, A. 1997. Assessment of genetic relationship among sexual and asexual forms of Allium cepa using morphological traits and RAPD markers. Heredity Journal, 78: 403-409.

Falconer, D. S. 1989. Introduction to Quantitative Genetics. (3rd edition), Longman, New York. 415 pp.

Fischer, D. and Bachman, K. 2000. Onion Microsatellites for germplasm analysis and their use in assessing intera and inter specific relatedness within the subgenus rhizirideum. Theoretical and Applied Genetics, 101: 153-164.

Kara, M. and Mishra, D. 1976. Catalase, Peroxidase and polyphenolxidase activities during rice leaf senescence. Plant Physiology Journal, 57: 315-319.

Karimi Nafchi, Z., Seyed Tabatabaei, E. and Mobli, M. 2011. Genetic diversity of onion genotypes using microsatellite markers. Iranian Journal of Horticultural Science, 42(1): 11-20.

Khokhar, K. M., Hadley, P. and Pearson, S. 2007. Effect of cold temperature duration of onion sets in store on the incidence of bolting, bulbing and seed yield. Scientia Horticulturae, 112: 16-22.

Mahajan V. Akse, J. Havey, M. J. and Lawande, K. E. 2009. Genetic fingerprinting of onion cultivars using SSR mark­ers. Indian Journal of Horticulture, 66: 62-68.

McCallum, J., Thomson, S. and Kenel, F. 2006. Assessment of genetic diversity in bulb onion (Allium cepa L.) using simple sequence repeat. San Digobusiness Journal, PP.130.

Moosavizadeh, A., Toorchi, M., Moghaddam, M., Mohammadi, S. A. and Masiha, S. 2005. Genetic diversity of Iranian onion landraces using RAPD marker. Agriculture Science, 16(1): 265-277.

Murray, G. C. and Thampson, W. F. 1980. Rapid isolation of high molecular DNA. Nucleic Acid Resources, 8: 4321-4325.

Pirseyedi, S. M., Mardi, M., Naghavi, M. R., Iran Doost, H. P., Sadeghzadeh, D., Mohammadi, S. A. and Ghareyazie, B. 2006. Evaluation of genetic diversity and Identification of informative markers for morphological characters in Sardari derivative wheat lines. Pakistan Journal of Biological Sciences, 9: 2411-2418.

Ribeiro-Carvalho, C., Guedes-Pinto, H. and Igregas, G. 2004. High levels of genetic diversity throughout the range of the Portuguese wheat landrace Barbela. Annals of Botany Journal, 94: 699-705.

Shourvazdi, A., Mohammadi, S. A., Norozi, M. and Sadeghzadeh, B. 2014. Molecualr analysis of genetic diversity and relationships of barley landraces based on microsatellite markers. Journal of Plant Genetic Research, 1(1): 51-64. 

Wiebe, H. J. 1990. Vernalization of vegetable crops- A review. Acta Horticulturae Journal, 267: 323-328.

Yun Hyun, D., Kim, O. Y., Bang, K. H., Kim, Y. Ch., Yoo, N. H., Kim, Ch. W. and Lee, J. H. 2009. Genetic and molecular studies for regulation of bolting time of onion (Allium cepa L.). Journal of Plant Biology, 52: 602-608.