ردیابی، پراکنش و تنوع ژنتیکی ویروئید کوتولگی رازک در باغات پرتقال استان مازندران

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه یزد، یزد، ایران

2 دانش‌آموخته کارشناسی‌ارشد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

3 استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه بیرجند، بیرجند، ایران

4 استاد، گروه گیاه‍‍پزشکی، دانشکده علوم زراعی، دانشگاه کشارزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران

چکیده

بیماری کاککزیای درختان مرکبات ناشی از ویروئید کوتولگی رازک (Hop stunt viroid, HSVd) یکی از بیماری‌های مهم اقتصادی مرکبات می‌باشد که منجر به خسارت جبران‌ناپذیری در باغات مرکبات می‌شود. به‌منظور ردیابی و تعیین پراکنش ویروئید کوتولگی رازک در باغات پرتقال نظیر والنسیا، تامسون، واشنگتن و پرتقال خونی در استان مازندران، نمونه‌برداری طی سال باغی 2019-2020 انجام شد. تعداد 173 نمونه به‌طور تصادفی از مناطق نمونه‌برداری شده برداشت شد. از کیت ترایزول برای استخراج RNA از بافت برگ گیاهان استفاده شد. واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز با نسخه‌برداری معکوس و با استفاده از جفت آغازگر اختصاصی جهت شناسایی ویروئید مورداستفاده قرار گرفت. نتایج این تحقیق نشان داد که عامل ویروئیدی عملاً در اکثر مناطق نمونه‌برداری قابل‌ردیابی می‌باشد. میزان پراکنش عامل بیماری در استان به‌طور متوسط 06/45 درصد تعیین گردید که در این میان، بالاترین میزان پراکنش مربوط به روستای سارو (2/72 درصد) بود. در نواحی مربوط به مناطق بهنمیر چالوس و فریدون‌کنار، عامل ویروئیدی تشخیص داده نشد. الگوی چندشکلی فرم فضایی رشته‌های تک‌لا (SSCP)  جدایه‌های متفاوتی از عامل ویروئیدی را نشان داد. آنالیز فیلوژنتیک توالی‌ها نشان داد که جدایه‌ها در 4 گروه ژنتیکی قرارگرفته که گروه اول و دوم هتروژنیک و دو گروه دیگر مونوژنیک می‌باشد. با توجه به نتایج به‌دست‌آمده چنین نتیجه‌گیری می‌شود که تغییرات در ساختار ثانویه مولکول RNA حلقوی جدایه ویروئید کوتولگی رازک در میزبان‌های مختلف می‌تواند منجر به گسترش دامنه میزبانی ویروئید شود.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Detection, Distribution and Genetic Diversity of Hop Stunt Viroid in Orange Orchards of Mazandaran Province

نویسندگان [English]

  • Seyed Kazem Sabbagh 1
  • Seyedeh Masomeh Sadati 2
  • Morteza Ghorbani 3
  • Heshmatolla Rahimian 4
1 Associate Professor. Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Yazd University, Yazd, Iran
2 MSc Graduate, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
3 Assistant Professor, Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Birjand, Birjand, Iran
4 Professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University, Sari, Iran
چکیده [English]

Citrus Cachexia disease caused by Hop stunt viroid is one of the important economic diseases of citrus plants that can lead to non-compensable damage in citrus orchards. In order to detection and distribution of HSVD in orang orchards such as Valencia, Tamson, Washington and Blood variety oranges in the Mazandaran province sampling was done during 2019-2020 horticultural season. A 173 numbers was accidently harvested from sampling regions. RNA extraction was done from leaf tissue using Trizol reagents. Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) method with specific primers was used to identification of viroid. The results of this research showed that viroid agents was practically identified in majority of sampling area. The average distribution of disease was determined as 45.06 percent that of all the maximum distribution (72.2%) was related to Saroo village. In the Bahanmir, Chaloos and Fereidonkenar regions, the viroid agent was not detected. Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) pattern showed the different isolates of viroid in sampling regions. Phyllogenetic analysis of obtained sequences showed the isolated are divided into 4 genetic groups that the first and second group are heterogenic and other two groups are monogeneic. Based on these results, it can be concluded that changes in the secondary structures of circular mRNA molecule of hop stunt viroid strain in the different host could lead to spread of viroid host range.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Hot stunt viroid
  • Citrus cachexia
  • Molecular diagnostic