جداسازی، شناسایی مورفولوژیکی و مولکولی و بررسی تنوع قارچ‌های اندوفیت گیاه کَبَر (Capparis spinosa)

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

2 دانشیار، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

3 دانشیار، گروه باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران

4 دانشیار، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران

چکیده

اندوفیت‌ها میکروارگانیسم‌هایی هستند که حداقل یک مرحله از چرخه زندگی خود را درون گیاهان بدون ایجاد علائم بیماری سپری می‌کنند. پژوهش حاضر به‌منظور شناسایی و بررسی تنوع قارچ‌های اندوفیت موجود در گیاه کَبَر انجام شد. نمونه‌برداری از 10 منطقه کشور انجام شد. از هر منطقه چهار گیاه براساس طرح نمونه‌گیری سیستماتیک تصادفی انتخاب شده و نمونه‌برداری از بافت‌های مختلف (شامل برگ، ساقه، ریشه و میوه) صورت گرفت. نمونه‌ها پس از ضدعفونی سطحی بر روی محیط‌های کشت قرار گرفتند و جدایه‌های قارچی به‌دست‌آمده خالص‌سازی شدند. شناسایی ایزوله‌ها با توالی‌یابی ناحیه ITS1-5.8S-ITS2 انجام شد. در مجموع 72 جدایه به‌دست آمد، که در 6 راسته و 10 جنس قرار گرفتند. بین جدایه‌ها 83/95 درصد متعلق به شاخه Ascomycota بوده و در شش راسته Eurotiales، Sordariales، Pleosporales، Diaporthales، Hypocreales و Mucorales قرار گرفتند. در این پژوهش گونه‌های Alternaria sp. و Aspergillus tubingensis بیش‌ترین فراوانی را داشته و حدود نیمی از قارچ‌های اندوفیت (25/49) از دو منطقه خداآفرین و آب‌بَر جدا شدند که به‌نظر می­رسد حضور قارچ‌های اندوفیت در گیاهان مناطق سردتر و کوهستانی بیش‌تر است. هم‌چنین میزان کل درصد کلونیزاسیون گیاه کبر 25/11 درصد بود که بیش‌ترین درصد در بافت ریشه (00/50 درصد) و کم‌ترین در بافت میوه (17/4 درصد) دیده شد، که احتمال تأثیر همزیستی قارچ­های خاکزی در مجاورت ریشه را بیش‌تر نمایان می­سازد. از میان گونه‌های جداسازی شده گونه‌های Chaetomium globosum، Diaporthe foeniculina، Mucor circinelloides و Stemphyliu vesicarium برای اولین‌بار از ایران در گیاه کَبر و گونه­های قارچی شناسایی شده برای اولین‌بار در دنیا به‌عنوان قارچ اندوفیت گیاه کَبر گزارش می‌شوند.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Isolation, Molecular and Morphological Identification and Diversity of Endophytic Fungi from Capparis spinosa L.

نویسندگان [English]

  • Mohsen Rajabi 1
  • Mohammad Reza Azimi Moghadam 2
  • Ali Azizi 3
  • Jalal Soltani 4
1 PhD Student, Department of Plant Production and Genetic, Faculty of Agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran
2 Associate Professor, Department of Plant Production and Genetic, Faculty of Agriculture, University of Zanjan, Zanjan, Iran
3 Associate Professor, Department of Horticultural Sciences, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
4 Associate Professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
چکیده [English]

Endophytes are microorganisms that spend at least one stage of their life cycle into plants without causing any symptoms. This study was conducted to identify and survey diversify of endophytic fungi in Capparis spinosa. Sampling was performed from 10 areas. Four healthy plants were selected from each region based on a systematic random sampling design and Samples were taken from different plant tissues (including leaves, stems, roots and fruits). After surface disinfection, the samples were placed on medium and the obtained fungal isolates were purified. Isolates were identified by sequencing ITS1-5.8S-ITS2. Totally, 72 isolates were obtained, which include 6 orders and 10 genera. Among isolates, 95.83% belonged to Ascomycota and they were divided into six orders, namely; Eurotiales, Sordariales, Pleosporales, Diaporthales, Hypocreales and Mucorales. In this study, Alternaria sp. and Aspergillus tubingensis had the highest abundance and about half of the endophytic fungi (49.25) were isolated from the two mountainous regions of Khodafarin (East Azerbaijan) and Ab-Bar (Zanjan) which it seems to be the presence of endophytic fungi in plants in colder and mountainous areas is more than others. Also, the total percentage of colonization was 11.25% and the highest percentage of colonization was seen in root tissue (50.00%) and the lowest in fruit tissue (4.17%), which can increase the probability of the effect of coexistence of soil fungi in the vicinity of the root. Among the isolated species, Chaetomium globosum, Diaporthe foeniculina, Mucor circinelloides and Stemphyliu vesicarium are reported for the first time from Iran for Caper, and fungal species identified for the first time in the world are reported as Caper endophytic fungi.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Caper
  • Symbiotic Fungi
  • Biodiversity
  • Facial features
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)
دوره 12، شماره 1
شهریور 1400
صفحه 11-29

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار