مقایسه شترهای تک کوهانه و دوکوهانه ایران براساس ژن MYF5 مرتبط با صفات رشد

نوع مقاله: علمی - پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج

2 استاد گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج

چکیده

تردی گوشت یکی از صفات مهم در صنعت تولید گوشت و یکی از خصوصیات مهم از نظر مصرف­کننده می­باشد. ژن میوژنیک فاکتور 5 (MYF5) نقش کلیدی تنظیم­کنندگی در تشکیل و توسعه ماهیچه اسکلتی ایفا می­کند و به­عنوان یک ژن کاندیدا در صفات مرتبط با رشد و کیفیت گوشت به­شمار می­رود. در این پژوهش از تعداد 40 نفر شتر دوکوهانه و 140 نفر از سه جمعیت مختلف شتر تک­کوهانه به­صورت تصادفی خون­گیری به­عمل آمد. برای تعیین تنوع ژنتیکی در اگزون 1 ژن MYF5 از روش PCR-SSCP استفاده شد و چهار الگوی متفاوت مشاهده گردید. توالی­یابی جهش در موقعیت­های 99 و 367 را نشان داد که به­ترتیب تغییر نوکلئوتید A به G و G به A را موجب می­شود و باعث ایجاد چهار هاپلوتایپ که مرتبط با چهار الگوی متفاوت بودند، می­شود. همچنین فاصله ژنتیکی نشان داد که شترهای دوکوهانه نسبت به جمعیت­های دیگر شترهای تک­کوهانه دارای فاصله ژنتیکی بیشتری می­باشند.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Comparison of Iranian One and Two Humped Camels Based on MYF5 Gene Associated With Growth Traits

نویسندگان [English]

  • nemat hedayat ivarigh 1
  • seyed reza miraee ashtiyani 2
  • Mohammad moradi share babak 2
چکیده [English]

Tenderness is one of the important characteristics of meat and desired to consumers. MYF5 plays a key role in the regulating of formation and development of skeletal muscle and considered as a candidate gene associated with growth and meat quality characteristics. In this study blood samples from 180 camels; include 40 Camelus bactrinus and 140 Camelus deramedarius was randomly collected. To ascertain whether there was variation in the camel MYF5 gene, we have developed a method of PCR–single-strand conformational polymorphism (PCR–SSCP) analysis. In this study, exon 1 region of the MYF5 gene were investigated and four unique SSCP patterns observed. Two SNPs were detected with substitution of A/G and G/A in 97 and 367 position, respectively that create four haplotypes, related to banding patterns. In comparison to the other populations of one humped camels, genetic divergence between populations showed that Bactrian camels have a greater genetic distance.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Camelus bactrianus
  • Camelus dramedarius
  • Genetic distance
  • PCR-SSCP
Beuzen, N. D., Stear, M. J. and Chang, K. C. 2000. Molecular marker and their use in animal breeding. Veterinary Journal, 160(1):13-4.

Deeb, N. and lamont, S. J. 2002. Genetic architecture of growth and body composition in unique chicken population. Journal of Heredity, 93:107-118.

Ghosh, T. 2000. Studies on codon usage in Entamoeba histolytica. International Journal Parasitology, 30: 715-722.

Hall, T. A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, 41, 95-98.

Heifetz, E. M., Fulton, J. E., Osulliv, N., Zhao, H., Dekkers, J. C. M. and Soller, M. 2005. Extent and consistency across generations of linkage disequilibrium in commercial layer chicken breeding populations. Genetics, 171:1173-1181.

Jing-Fen, K., Xiang-Long, L., Rong-Yan, Z., Lan-Hui, L., Fu-Jun, F. and Xiu-Li, G. 2008. Bioinformatics analysis of lactoferrin gene for several species. Biochemistry Genetic, 46: 312-322.

Jiyeon, S., Jae, D. O., Cheong, C., Kun,  W. L., Hak, K. L., Dong, S. S., Gwang, J. J., Kyung, D. P. and Hong, S. K. 2011. Association between polymorphisms of MYF5 and POU1F1 genes with growth and carcass traits in Hanwoo (Korean cattle). Gene and Genome, 33: 425-430.

Li, X. L., Zheng, G. R. and Zhou, R.Y. 2007. Evolution and differentiation of MSHR gene in different species. Journal of Heredity, 3: 165-168.

Librado, P. and Rozas, J. 2009. Dnasp v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics, 25: 1451-1452.

Linville, R. C., Pomp, D., Johnson, R. K. and Rothschild, M. F. 2001. Candidate gene analysis for loci affecting litter size and ovulation rate in swine. Journal of Animal Science, 79: 60-67.

Lynch, M. and Crease, T. J. 1990. The analysis of population survey data on DNA sequence variation. Molecular Biology and Evolution, 7: 377-394.

Maak, S., Neumann, K. and Swalve, H. H. 2006. Identification and analysis of putative regulatory sequences for the MYF5/MYF6 locus in different vertebrate species. Genetics, 379: 141-147.

Robert, F. W. 2001. Molecular biology. University of Kansas-Lawrence, Scientific Press.

Sajee, K.,  Huitong, Z. and Jon, G. H. H. 2009. Allelic Variation in the Porcine MYF5 Gene Detected by PCR–SSCP. Molecular Biology, 41: 208-212.

Shah, M. G., Qureshi, A. S., Resissmann, M. and Schwartz, H. J. 2007. Single nucleotide polymorphism in the coding redion of MYF5 gene of the camel (camelus deromedarius). Pakistan Veterinary journal, 27(4):163-166.

Tajima, F. 1983. Evolutionary relationship of DNA sequences in finite populations. Genetics, 105: 437-460.

Tamura, K., Dudley, J., Nei, M. and Kumar, S. 2007. MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Biology and Evolution, 24: 1596-1599.

TePas, M. F. W. and Visscher, A. H. 1994. Genetic regulation of meat production by embryonic muscle formation: a review. Journal of Animal Breeding and Genetic, 111: 404-412.

Ujan, J. A., Zan, L. S., Wang, H. B. and Ujan, S. A., 2011. The effect of myogenic factor 5 polymorphism on the meat quality in chinese Bos Taurus. Agriculture Construction Science, 76: 373-377.

Yin, H., Zhang, Z., Lan, X., Zhao, X., Wang, Y. and Zhu, Q. 2011. Association of MYF5, MYF6 and Myog gene polymorphism with carcass traits in chinese meat type quality chicken populations. Journal of Animal and Veterinary Advances, 10(6): 704-708.