بررسی تنوع ژنتیکی بین ارقام تجاری و ژنوتیپ‌های ناشناخته مرکبات مقاوم به تنش خشکی با استفاده از نشانگرهای ISSR

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار، گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، واحد تنکابن، دانشگاه آزاد اسلامی، تنکابن، ایران

2 دانش آموخته کارشناسی‌ارشد، گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، واحد تنکابن، دانشگاه آزاد اسلامی، تنکابن، ایران

3 دانشیار، عضو هیأت علمی پژوهشکده مرکبات و میوه های نیمه‌گرمسیری، رامسر، ایران

چکیده

مرکبات از خانواده روتاسه بوده که هم از لحاظ صنعتی و هم کشاورزی حائز اهمیت فراوان است. این پژوهش به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی در بین ارقام تجاری و ژنوتیپ‌های ناشناخته مرکبات مقاوم به تنش خشکی با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR انجام شد که ژنوتیپ 28 نمونه از مرکبات با استفاده از 10 نشانگر مذکورموردارزیابی قرار گرفت. تجزیه خوشه‌ای بر اساس ضریب تشابه تطابق ساده و روش UPGMA انجام گرفت و در نهایت در ضریب ‌تشابه 64/0 ژنوتیپ‌های موردمطالعه به پنج گروه تقسیم شدند. نتایج نشان داد کم‌ترین شباهت (43/0) بین ژنوتیپ ناشناخته (G5) با ژنوتیپ ناشناخته (G1) و ماکروفیلا (G21) با ژنوتیپ شانگشا (G4) وجود داشت و بیش‌ترین شباهت (91/0) بین ژنوتیپ لیمو لیسبون (G28) و ژنوتیپ لیموشیرین (G26) مشاهده شد. هم‌چنین سطح بالایی از چندشکلی با نشانگرهای ISSR در این مطالعه یافت شد. محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) در محدوده 275/0 تا 359/0 و میانگین درصد چندشکلی 82/88 درصد به ازای هر پرایمر بود.این نتایج نشان داد که ISSR تکنیک مولکولی مناسبی برای بررسی تنوع ژنتیکی ارقام موردمطالعه است.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Evaluation of Genetic Diversity AmongCitrus Commercial Cultivars and Unknown Genotypes Resistant to Drought Stress Using ISSR Markers

نویسندگان [English]

  • zeinab khazaei koohpar 1
  • Pouneh Salehnia 2
  • Behrouz Golein 3
1 Assistant Professor, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Biological Sciences, Tonekabon Branch, Islamic Azad University, Tonekabon, Iran
2 Master Graduate, Department of Cellular and Molecular Biology, Faculty of Biological Sciences, Tonekabon Branch, Islamic Azad University, Tonekabon, Iran
3 Associate Professor, Faculty Member in Research Institute of Citrus and Subtropical Fruits, Ramsar, Iran
چکیده [English]

 Citrus belongs to rutaceae family, which has great importance both from industrial and agricultural aspects. This study
was conducted to assess genetic diversity in Citrus commercial cultivars and unknown genotypes resistant to drought
stress using ISSR molecular markers that 28 citrus genotypes were evaluated using 10 ISSR markers. The Cluster
analysis was performed according to the Simple Matching similarity coefficient and UPGMA algorithm and finally, the
studied genotypes were divided into five groups at similarity coefficient of 0.64. Results indicated that the lowest
similarity (0.43) was observed between two unrecognized genotype G5 and G1, as well as between Alemow (G21) and
Changsha (G4) genotypes. However, the highest similarity (0.91) was observed between Lisbon lemon (G28) and
Sweet lime (G26) genotypes. Likewise, it was observed high levels of polymorphism with ISSR markers in the present
study. The value of Polymorphism Information Content (PIC) ranged from 0.275 to 0.359 and the average of
polymorphic percentage was 88.82% per primer. These results showed that ISSR markers are a suitable molecular
technique for genetic diversity analysis of the studied genotypes. 

کلیدواژه‌ها [English]

  • Citrus rootstocks
  • Molecular markers
  • PIC
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)
دوره 10، شماره 1
شهریور 1398
صفحه 9-16

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار