ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام مختلف گوجه‌فرنگی با استفاده از نشانگرهای RAPD و ISSR

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسیارشد، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

2 دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران

3 مربی، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پژوهشکده کشاورزی، پژوهشگاه زابل، زابل، ایران

چکیده

در این تحقیق 14 توده و رقم گوجه‌فرنگی با استفاده از 10 آغازگر RAPD و 10 آغازگر ISSR مورد ارزیابی قرارگرفته است. در نشانگر RAPD، بیش‌ترین میزان شاخص چندشکلی (41/0) مربوط به آغازگر TIBMBA02 و TIBMBB17 و کم‌ترین میزان شاخص چندشکلی (19/0) مربوط به آغازگر TIBMBC12 و در نشانگر ISSR، بیش‌ترین میزان شاخص چندشکلی (42/0) مربوط به آغازگر UBC808 و کم‌ترین میزان شاخص چندشکلی (23/0) مربوط به آغازگر UBC864 به‌دست آمد. در اطلاعات مجموع دو نشانگر بیش‌ترین درصد چندشکی (72/80)، شاخص تنوع نی (44/0)، شاخص تنوع شانن (48/0) و تعداد آلل مؤثره (6/1) متعلق به رقم عنبر ایرانی بود. کم‌ترین میزان تشابه (368/0) مربوط ارقام عنبر ایرانی و Y کشیده بود. تغییرات درون و بین ارقام با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که 79 درصد کل تغییرات ژنتیکی به تنوع درون ارقام اختصاص داشت.  نتایج تجزیه خوشه‌ای به‌صورت توأم طبق نشانگر RAPD و ISSR ارقام مختلف گوجه‌فرنگی را به چهار گروه مختلف طبقه‌بندی نمود که بر اساس موقعیت جغرافیایی از همدیگر تفکیک شدند. جهت به‌دست آوردن رقم برتر پیشنهاد می‌گردد رقم عنبر ایرانی به‌عنوان یکی از پایه‌های اصلاحی پدری یا مادری با رقم Y کشیده و رقم US107 که از کشورهای ایتالیا و امریکا هستند و از لحاظ تولید در سطح بالاتری نسبت به ارقام ایرانی قرار دارند تلاقی داده شود.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Evaluation of Genetic Diversity in Different Cultivars of Tomato Using RAPD and ISSR Markers

نویسندگان [English]

  • Zahra Jahantigh-Haghighi 1
  • Leila Fahmideh 2
  • Bahman Fazeli nasab 3
1 MSc Former, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
2 Associate Professor, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Gorgan, Iran
3 Instructor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Agriculture Institute, Research Institute of Zabol, Zabol, Iran
چکیده [English]

In this study, fourteen tomato landraces and cultivars were evaluated using ten RAPD primers and ten ISSR primers. In RAPD marker, the most polymorphism index (0.41) has belonged to TIBMBA02 and TIBMBB17 primers and the lowest polymorphism index (0.19) has belonged to TIBMBC12 primer, and in ISSR marker, the most polymorphism index (0.42) has belonged to UBC808 primer and the lowest polymorphism index (0.23) has belonged to UBC864 primer. In the total merged data of the two markers, the most percent of polymorphism (80.72), Nei diversity index (0.44), Shannon diversity index (0.48) and effective allele number (1.6) belonged to Iranian Anbar cultivar. The lowest similarity index (0.368) was belonged to Iranian Anbar cultivar and also Y Keshideh. The diversity of inter and intra landraces and cultivars was shown 79 percent of all the diversity in total variances based on analysis of molecular variance. Cluster analysis, based on the total merged data of the two markers, was grouped all landraces and cultivars into 4 groups but they were not grouped according to the geographical zone. To obtain a superior cultivar, it is recommended that the Iranian Anbar cultivar can be cross-fertilized with either Y or US107 cultivars from Italy and the United States, which are higher in production than Iranian cultivars.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Cluster analysis
  • Genetic distance
  • DNA marker
  • Molecular variance