تنوع نوکلئوتیدی ژن β-ocimen Syntethase در ژنوتیپ‌های حساس و مقاوم لوبیا به کنه تارتن دولکه‌ای (Tetranychus urticae)

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

2 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

چکیده

برگ‌‌های گیاهان در اثر صدمه گیاه‌خواران تولید ترکیب β-ocimen می‌کنند و آنزیم β-ocimen syntethase (OS) تولیدکننده آن است. توالی ژن OS در بانک های اطلاعاتی برای لوبیا وجود ندارد. تنوع نوکلئوتیدی ژن OS در ژنوتیپ‌های مقاوم (ناز و KS41128) و حساس (اختر و G11867) لوبیا به کنه تارتن دولکه‌ای موردبررسی قرار گرفت. بذور در گلدان کشت شدند و در مرحله 2-3 برگی DNA ژنومی استخراج گردید و PCR با یک جفت آغازگر اختصاصی انجام شد. محصولاتPCR توالی‌‌یابی شدند و با توالی‌‌های OS در پایگاه NCBI مقایسه و میزان شباهت آن‌ها بررسی گردید. توالی‌یابی DNA نشان داد ژنوتیپ‌های ناز و KS41128 بیش‌ترین تشابه را داشتند. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد ژنوتیپ‌‌های موردمطالعه در یک گروه و نمونه‌های NCBI در گروه دیگر قرار گرفتند. هم‌چنین، نمونه‌های حساس و مقاوم از همدیگر تفکیک شدند. توالی این ژن در ژنوتیپ‌ها چند‌شکلی تک نوکلئوتیدی نشان نداد که نشان‌دهنده حفاظت این ناحیه از ژن در لوبیا است.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Nocleotid Variation of β-ocimen Syntethase Gene in Two Spotted Spider Mite (Tetranychus urticae) Resistant and Susceptible Common Bean Genotypes

نویسندگان [English]

  • Akhtar Solieman 1
  • Zahra Tahmasebi 2
  • Arah Fazeli 2
1 MSc Graudate, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam, Iran
2 Associate Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ilam University, Ilam, Iran
چکیده [English]

The leaves of plants produce β-ocimen due to damage of herbivors. β-ocimen syntethase (OS) is the enzyme that produces it. There are no OS gene sequences in common bean databases. Nucleotide diversity of OS gene in resistant (Naz and KS41128) and susceptible (Akhtar and G11867) common bean genotypes was evaluated. Seeds were planted in pots and genomic DNA was extracted in 2-3 leaf stage and PCR was performed with a specific primer pair. PCR products were sequenced and compared with OS sequences in the NCBI database and their similarity was assessed. DNA sequencing showed that Naz and KS41128 were most similar. Phylogenetic analysis showed that the studied genotypes were in one group and NCBI samples were in the another group. Also, susceptible and resistant genotypes were separated from each other. The sequence of this gene in genotypes did not show single nucleotide polymorphism, which indicates the protection of this region of the gene in common bean.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Phylogenetic analysis
  • Database
  • Polymorphism
  • Herbivors
دوفصلنامه فن آوری زیستی در کشاورزی(علمی-پژوهشی)
دوره 12، شماره 1
شهریور 1400
صفحه 51-57

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار