ردیابی مولکولی ویروس کوتولگی گندم در مزارع غلات استان همدان

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران

2 استادیار، گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان، ایران

10.22084/ab.2024.29250.1494

چکیده

بیماری کوتولگی گندم یکی از مهم‌ترین بیماری‌های گندم می‌باشد. عامل آن ویروس کوتولگی گندم (WDV, Wheat dwarf virus) است که متعلق به جنس Mastrevirus از تیره‌ی Geminiviridae می‌باشد. WDV در اکثر نقاط ایران پراکنش دارد. با‌توجه‌به اهمیت کشت غلات در استان همدان، به‌منظور ردیابی این ویروس در فصول زراعی ۱۴۰۱ و ۱۴۰۲، نمونه‌برداری از گیاهان گندم و جو دارای علائم زردی و کوتولگی مزارع شهرستان‌های ملایر، تویسرکان، نهاوند، همدان، لالجین، بهار، اسدآباد، فامنین، کبودرآهنگ و رزن انجام شد. استخراج دی ان ای کل از برگ‌های دارای علائم با استفاده از بافر CTAB انجام شد. آزمون PCR با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی که قطعه‌ای با اندازه ۸۴۷ جفت باز از ژنوم WDV را تکثیر می‌کند، انجام شد. بررسی‌ها مشخص نمود که این ویروس در بعضی از مناطق نمونه‌برداری شده وجود دارد. قطعات تکثیر شده در آزمون PCR مربوط به جدایه‌های فامنین، کبودرآهنگ و رزن تعیین ترادف شدند. ترادف نوکلئوتیدی این جدایه‌ها بیش‌ترین میزان شباهت را با دو جدایه از گونه WDV-W شامل جدایه‌های KU877928 وMH477622  به‌ترتیب با ۹۹ درصد و ۹۸ درصد تشابه نشان دادند و با سایر جدایه‌های گونه WDV-W موجود در بانک ژن بین ۹۶ درصد تا ۹۸ درصد شباهت دارند. شباهت این سه جدایه با جدایه‌های گونه WDV-B بین ۸۴ درصد تا ۸۶ درصد است. تحقیق حاضر اولین گزارش از آلودگی مزارع استان همدان به گونه WDV-W می‌باشد.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Molecular Detection of Wheat Dwarf Virus in Cereal Fields of Hamedan Province

نویسندگان [English]

  • Fatemeh Tajook 1
  • Arezoo Pakdel. 2
1 MSc Student, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Bu- Ali Sina University, Hamedan, Iran
2 Assistant Professor, Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Bu- Ali Sina University, Hamedan, Iran
چکیده [English]

Wheat dwarf disease which causes by Wheat dwarf virus (WDV), is one of the most important diseases of wheat. This virus is a member of the Mastrevirus genus and Geminiviridae family. WDV is widespread in most parts of Iran. Considering the importance of grain cultivation in Hamedan province, in order to detect of this virus, wheat and barley plants with symptoms of dwarfing and yellowing were sampled from the fields of Malayer, Tuyserkan, Nahavand, Hamedan, Lalejin, Bahar, Asadabad, Famenin, Kabudrahang and Razan counties during growth seasons of 2022 and 2023. Total DNA was extracted from the symptomatic leaves using CTAB buffer. The PCR test was performed using a specific primer pair that amplifies an 847 bp fragment of the WDV genome. According to the results, this virus is present in some sampled areas. The amplified fragments of Famenin, Kabudrahang and Razan isolates were sequenced. Nucleotide sequences of these isolates showed the highest degree of similarity with two isolates of WDV-W species including KU877928 and MH477622 isolates with 99% and 98% similarity, respectively. They have 96% to 98% similarity with other isolates of WDV-W species available in the GenBank. The similarity of these three isolates with the isolates of WDV-B species is between 84% to 86%. This is the first report of wheat dwarf virus (WDV-W) infection in wheat and barley fields in Hamadan province.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Nucleotide sequencing
  • Geminiviridae
  • PCR

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار